Florian Hanssen studierte Ev. Kirchenmusik an der Hochschule für Musik und Theater, Hamburg, sowie an der Universität der Hansestadt Historische Musikwissenschaft mit den Nebenfächern systematische Musikwissenschaft und evangelische Theologie (Abschluss: Magister artium, Alfred Huth und die norddeutsche Kulturpolitik).
Florian Hanssen ist seit 2008 Kantor an der Stadtkirche zu Glückstadt.